Doctoraat in de ingenieurswetenschappen: computerwetenschappen

Compressie en interoperabele representatie van genomische informatie


Doctorandus Publieke verdediging
Naam: Tom Paridaens   Datum: Woensdag 20/06/2018 om 16:00 
Adres: ()
, null null
  Lokatie: auditorium 1, iGent, eerste verdieping, Technologiepark Zwijnaarde 126, 9052 Zwijnaarde
Contact FEA: info.ea@ugent.be   Taal: Nederlands

Curriculum
Licenciaat in de Informatica, UGent, 2006

Promotor
Peter Lambert
Wesley De Neve

Examencommissie
prof. Filip De Turck
Peter Lambert (EA06)
Wesley De Neve (EA06)
Hannes Pouseele
Jaime Delgado
Jan Fostier
Glenn Van Wallendael, Universiteit Gent, Faculteit Ingenieurswetenschappen en Architectuur, EA06 - Vakgroep Elektronica en Informatiesystemen, Technologiepark Zwijnaarde 122,Technologiepark Zwijnaarde 126, 9052 Zwijnaarde
E: glenn.vanwallendael@ugent.be
Yvan Saeys

Onderzoeksthema

In de voorbije decennia is er een enorme vooruitgang geboekt bij de technologieën die gebruikt worden voor DNA sequencing. De kost voor het sequencen van het menselijk genoom is gezakt van meer dan 10 miljoen dollar in 2007 naar minder dan 1000 dollar nu. Terzelfdertijd is de tijd die nodig is om een menselijk genoom te sequencen gezakt van enkele jaren naar uren. Als gevolg van deze evoluties stijgt de hoeveelheid gegenereerde gegevens exponentieel. In deze doctoraatsthesis worden verschillende oplossingen beschreven voor het effectief opslaan van deze data. Hierbij werd naast compressie-effectiviteit ook de nadruk gelegd op bruikbaarheid en functionaliteit. Dit onderzoek lag mede aan de basis van de MPEG-G standaard voor de representatie, compressie en het beheer van genomische data, ontwikkeld door MPEG (Moving Picture Experts Groep).


Taal proefschrift
Engels

Documenten